Karboksipeptidaz

tanım

Karboksipeptidazlar, amino asitleri proteinlerden veya peptitlerden ayıran enzimlerdir. Proteinler, farklı amino asitlerden oluşan uzun zincirlerdir. Peptitler de amino asitlerden oluşur ancak daha kısadır. Amino asitlerin temel yapısı her zaman aynıdır. Bir karbon atomu ile bir nitrojen atomu arasındaki bağlantının kurulması önemlidir.

Bunu bir insan zinciri gibi görselleştirebilirsiniz, sağ el karbon atomu ve sol el nitrojen atomudur. Zincirin her iki ucunda atomlardan biri serbest kalır. Karboksipeptidazlar, karbon atomunun serbest kaldığı proteinin sonundaki son amino asidi ayırır. Sözde C-terminal ucu olarak adlandırılır.

Enzim yalnızca uçlarından ayrılabildiğinden, buna ekzopeptidaz denir. Bir yandan, karboksipeptidazlar, sindirilen gıdanın parçalanmasında rol oynar; diğer yandan da yeni üretilen proteinleri değiştirir ve onları işlevsel durumlarına getirir.

Hangi karboksipeptidazlar vardır?

Karboksipeptidazlar farklı sistemlere ayrılabilir. Bir sistem, karboksipeptidazları, tercihen ayırdıkları amino asitlere göre böler. Bu sistemde, karboksipeptidazlar, harflerle gösterilen birkaç gruba ayrılır. En iyi bilinen gruplar A ve B gruplarıdır.

A grubu karboksipeptidazlar, dallı bir yapıya sahip olan ve aromatik bir halkaya sahip olan amino asitleri böler. Bu, karbon atomlarından oluşan ve kendine has özelliklere sahip özel bir yapıdır.

Grup B karboksipeptidazlar tercihen pozitif yüklü amino asitleri ayırır.

Karboksipeptidazları sınıflandırmak için diğer sistem, enzimleri aktif merkezlerinin doğasına göre ayırır. Aktif merkez, reaksiyonun gerçekleştiği enzim üzerindeki noktayı belirtir. Karboksipeptidazlar durumunda, aktif merkezde bir metal molekülün bulunduğu metalo-karboksipeptidazlar, aktif merkezde amino asit sistein bulunan tiyol-karboksipeptidazlar ve amino asit serinin aktif merkezde olduğu serin-karboksipeptidazlar arasında bir ayrım yapılır. Bununla birlikte, çeşitli aktif merkezler, hangi amino asidin ayrıldığını belirlemez.

Serin karboksipeptidazlar sınıfı üç enzimden oluşur: Tripsin, kimotripsin, elastaz.

Görev, işlev ve etki

Çeşitli karboksipeptidazların görevleri çok çeşitlidir. İlk keşfedilen karboksipeptidazlar sindirimde bir rol oynasa da bugün bilinen karboksipeptidazların çoğu diğer işlemler için önemlidir.

Sindirim sırasında karboksipeptidazların görevi, proteinleri ayrı ayrı amino asitlere bölmektir. Bu süreç çok önemlidir çünkü bağırsakta hiçbir protein emilmez, sadece tek tek amino asitler.

Karboksipeptidazlar, çeşitli proteinlerin olgunlaşma sürecinde vazgeçilmezdir. Proteinlerin üretildikten sonra tam olarak işlevsel olabilmesi için çeşitli modifikasyonların yapılması gerekir. Örneğin, tek tek amino asitler karboksipeptidazlar tarafından ayrılır. Bununla birlikte, bu modifikasyon, yalnızca karboksipeptidazlar yoluyla değil, diğer enzimlerle birlikte gerçekleşir. Ayrıca, karboksipeptidazlar, çeşitli peptitlerin üretiminde rol oynar.

Özellikle önemli bir peptit insülindir. İnsülin üretiminde çeşitli karboksipeptidazlar da rol oynar.

Nerede yapılır?

Karboksipeptidazların sindirime dahil olan kısmı pankreasta üretilir. Pankreas olarak da adlandırılan pankreas, doğrudan ince bağırsağa salınan pankreas salgıları üretir. Bu salgı enzimler açısından oldukça zengindir. Ayrıca asidik mide içeriğini nötralize eder. Bu salgı, daha önce pankreasta üretilen karboksipeptidazları içerir.

Pankreasın ne yaptığı hakkında daha detaylı bilgi için makalemizi okuyun.: Pankreasın işlevi

Eksiklik durumunda ne olur?

Karboksipeptidaz eksikliği varsa, ilgili işlem teorik olarak sınırlandırılmalıdır. Bununla birlikte, sindirime dahil olan karboksipeptidaz eksikliğinin etkileri hakkında pek bir şey bilinmemektedir. Muhtemelen, proteinlerin bölünmesi sürdürülebilir, çünkü belirli bir karboksipeptidaz eksikse, bir başkası devralabilir.

Enzimler tercihen ilgili amino asitleri ayırırlar, ancak gruplarına tam olarak uymayan amino asitleri de ayırabilirler. Bununla birlikte, karboksipeptidaz N eksikliğine dayanan bir hastalık vardır. Bu hastalıkta bağışıklık sistemi bozulur çünkü bu enzim hastalığa karşı savunmada görev alır.